По инициативе Правительства Санкт-Петербурга, в развитие Распоряжения Президента Российской Федерации от 03.04.1995 года № 155-рп, распоряжением мэра Санкт-Петербурга А.А. Собчака 25 апреля 1995 года был создан Первый морской кадетский корпус в Кронштадте.
Днем образования Морского кадетского корпуса в Кронштадте считается 22 ноября 1995 года. В этот день на торжественном построении с участием войск Кронштадтского гарнизона первым заместителем главнокомандующего Военно-Морским Флотом адмиралом Касатоновым И.В. кадетскому корпусу было вручено знамя морского кадетского корпуса.
В год 300-летнего юбилея Военно-Морского Флота России для продолжения традиций военно-морского образования распоряжением Президента Российской Федерации от 19.02.1996 г. № 73-рп Первый морской кадетский корпус был преобразован в Кронштадтский морской кадетский корпус и приобрел статус военно-морского учебного заведения с числом обучающихся – 700 кадет.
Корпус расположен в исторической части города Кронштадта в здании 1-ой «Западной оборонительной казармы Кронштадтской крепости».
Уникальность морского кадетского корпуса в Кронштадте была в том, что период обучения в этом учебном заведении был семь лет, а принимались в него мальчишки с 10-летнего возраста в 5-й класс, в то время как в других аналогичных учебных заведениях обучение начиналось с 9-го класса. С 2011 года опыт семилетнего довузовского образования был тиражирован на все аналогичные учебные заведения Министерства обороны Российской Федерации.
Приоритет в наборе в корпус отдавался детям сиротам, детям, оставшимся без родительской опеки, детям из семей военнослужащих отдаленных гарнизонов.
С этого момента началось его поэтапное развертывание от 75 человек принятых для обучения в 1995 году до 675 человек в 2007 году, с одновременным капитальным ремонтом и строительством учебно-материальной базы. С 31 декабря 2002 года Корпус именовался как государственное образовательное учреждение среднего (полного) общего образования Кронштадтский морской кадетский корпус.
С 1995 по 2007 год Кронштадтский морской кадетский корпус имел двойное учредительство в лице Правительства Санкт-Петербурга и Военно-Морского Флота и соответственно подчинялся Председателю Комитета по образованию Санкт-Петербурга и Главнокомандующему Военно-Морским Флотом России, через направление военного образования Военно-Морского Флота.
С 2007 года учебное заведение имеет одного учредителя – Министерство обороны Российской Федерации.
С 11 апреля 2007 года корпус получил статус федерального государственного образовательного учреждения среднего (полного) общего образования – Кронштадтский морской кадетский корпус Министерства обороны Российской Федерации.
С 1 апреля 2010 года Кронштадтский морской кадетский корпус перешел на комплектование существовавшего военного штата гражданскими специалистами.
С 18 июня 2010 года Корпус именовался как федеральное государственное общеобразовательное учреждение «Кронштадтский морской кадетский корпус Министерства обороны Российской Федерации».
С 1 сентября 2010 года введен новый штат и определена численность обучающихся – 560 кадет, Кронштадтский морской кадетский корпус был подчинен Департаменту образования Министерства обороны Российской Федерации.
С 30 августа 2011 года в соответствии с Указанием ГШ ВС РФ №314/10/2863 от 14.07.2011г. был осуществлен переход на штат 17/531-51(01).
Распоряжением Правительства Российской Федерации от 12 августа 2011 года № 1433-р федеральное государственное общеобразовательное учреждение «Кронштадтский морской кадетский корпус Министерства обороны Российской Федерации» переименовано путем изменения типа существующего в федеральное государственное казенное общеобразовательное учреждение «Кронштадтский морской кадетский корпус Министерства обороны Российской Федерации».
С 1 января 2012 года корпус стал называться федеральное государственное казенное общеобразовательное учреждение «Кронштадтский морской кадетский корпус Министерства обороны Российской Федерации».
1 сентября 2012 года на торжественном построении Кронштадтского морского кадетского корпуса на плацу учебного заведения прошел военный церемониал крепления полотнища Боевого Знамени нового образца Кронштадтского морского кадетского корпуса к древку. В этой церемонии приняли участие начальник Кронштадтского морского кадетского корпуса капитан 1 ранга Довбешко Н.В., заместители начальника корпуса, старшие воспитатели учебных рот и отличники учебы из числа кадет старших курсов.
В соответствии с Приказом Министра обороны Российской Федерации № 2042 от 06 июля 2012 года Главнокомандующий Военно-Морским Флотом Российской Федерации адмирал Чирков В. В. в торжественной обстановке на построении всего личного состава Корпуса 1 декабря 2012 года вручил начальнику Корпуса Довбешко Н. В. Боевое Знамя Кронштадтского морского кадетского корпуса нового образца.
С 1 апреля 2013 года федеральное государственное казенное общеобразовательное учреждение «Кронштадтский морской кадетский корпус Министерства обороны Российской Федерации» подчинен Главнокомандующему Военно-Морским Флотом Российской Федерации.
С 19 августа 2015 года федеральное государственное казенное общеобразовательное учреждение «Кронштадтский морской кадетский корпус Министерства обороны Российской Федерации» стал именоваться «Кронштадтский морской кадетский военный корпус Министерства обороны Российской Федерации». Основанием был приказ Статс-секретаря – заместителя Министра обороны Российской Федерации № 552 от 17.06.2015 года «Об утверждении новых редакций Уставов федеральных государственных казенных общеобразовательных учреждений Министерства обороны Российской Федерации».

Награды кадетского корпуса

2004 год – Кронштадтский морской кадетский корпус награжден кубком Главнокомандующего Военно-Морским Флотом России – «Лучшее учебное заведение довузовской подготовки Военно-Морского Флота», завоеванным за успехи в учебно-воспитательной деятельности.
2013 год – Кронштадтский морской кадетский корпус награжден Медалью Общественного Совета при Правительстве Российской Федерации «Бегущая по волнам» за достигнутые результаты в организации военно-патриотического воспитания молодежи.
2015 год – Кронштадтский морской кадетский корпус награжден Грамотой Главнокомандующего Военно-Морским Флотом России за высокие показатели в культурно-патриотической работе, успехи в развитии художественной самодеятельности, творческие достижения коллективов и исполнителей, воспитание всесторонне-развитого молодого поколения защитников Отечества.
2015, 2016, 2017 год - Кронштадтский морской кадетский корпус награжден Грамотой Министра обороны Российской Федерации за активное участие в Международных военно-технических форумах «Армия – 2015», «Армия – 2016», «Армия – 2017», «Армия – 2018», «Армия – 2021».
2018 год - Кронштадтский морской кадетский военный корпус награжден общественной наградой - орденом 1-ой степени «Во славу флота российского» наградной комиссией при правительстве Российской Федерации «За многолетнюю подготовку, воспитание и обучение кадет моряков, будущих офицеров флота российского» за № 0146.

Награды личного состава кадетского корпуса

2015 год - за проявленное отличие личный состав парадных расчетов Кронштадтского морского кадетского военного корпуса, награжден ведомственной медалью «За участие в военном параде в ознаменование 70-летия Победы в Великой Отечественной войне 1941-1945 г.г.».
2020 год - Личный состав парадных расчетов Кронштадтского морского кадетского военного корпуса, награжден ведомственной медалью «За участие в военном параде в ознаменование 75-летия Победы в Великой Отечественной войне 1941-1945 г.г.» за отличие, проявленное при проведении второго в истории Вооруженных Сил России военного парада 24 июня 2020 года на Красной площади в Москве и Дворцовой площади в Санкт-Петербурге.
Всего за участие в военных парадах ведомственной медалью «За участие в военном параде в День Победы» с 2013 по 2021 год награждено – 1590 кадет.
В 2019, 2021 г.г. медалью «За участие в Главном военно-морском параде» награждено 96 кадет.
За 26 лет в кадетском корпусе произведено 22 выпуска. Окончили Кронштадтский морской кадетский военный корпус 1475 выпускников, из них: 28 с золотой медалью, 16 – с серебряной.
Свыше 87% выпускников продолжили обучение в высших учебных заведениях Министерства обороны Российской Федерации.